Más allá de la secuencia: cómo el genoma se regula a través de modificaciones químicas e interacciones cromatínicas.
Ofrecemos los tres flujos epigenéticos más utilizados en investigación biomédica: análisis de metilación de citosinas (WGBS, RRBS), perfilado de modificaciones de histonas (ChIP-seq) y arquitectura cromatínica abierta (ATAC-seq).
Cada flujo viene acompañado de su pipeline bioinformático estándar de oro: Bismark/methylKit para metilación, MACS3 para peak calling de ChIP/ATAC, y deepTools para visualizaciones.
Aplicaciones: oncoepigenética, biología del desarrollo, respuesta a estímulos ambientales, biomarcadores de envejecimiento, herencia epigenética.
| FASTQ crudos | Por muestra |
|---|---|
| BAM | Alineamiento a referencia |
| Resultados específicos | BedGraph metilación / BED peaks |
| Análisis diferencial | DMRs / DiffBind / DESeq2 |
| Reporte HTML | Visualizaciones interactivas |
Whole-Genome Bisulfite Sequencing — metilación de cada citosina en el genoma.
| Cobertura | 15–30x |
|---|---|
| TAT | 6–8 sem. |
Reduced Representation Bisulfite Seq — enfoque en regiones CpG-ricas a menor costo.
| Cobertura CpG | 20–30x |
|---|---|
| TAT | 5 sem. |
Perfilado de unión de proteínas (TFs, histonas) o accesibilidad cromatínica.
| Reads | 20–50 M PE |
|---|---|
| TAT | 5–6 sem. |