Perfila bacterias, arqueas y hongos con resolución de un solo nucleótido (ASV) o reconstruye genomas completos desde una muestra ambiental.
Ofrecemos las dos grandes familias de análisis microbiómico: amplicones marcadores (16S rRNA para bacterias/arqueas, ITS para hongos, 18S para eucariontes), y shotgun metagenomics para resolución funcional y a nivel de cepa.
Nuestro pipeline estándar de amplicones usa DADA2 para resolución por ASV (Amplicon Sequence Variant), eliminando los problemas de OTUs al 97% y permitiendo distinguir especies por una sola base.
Aplicaciones: microbioma humano (intestinal, oral, vaginal, piel), microbioma animal, suelos agrícolas, ambientes acuáticos, fermentaciones industriales, vigilancia de patógenos.
| FASTQ crudos | R1 + R2 demultiplexados |
|---|---|
| Tabla ASV/OTU | Por muestra · biom + tsv |
| Taxonomía | SILVA · UNITE · GTDB |
| Diversidad α | Shannon · Simpson · Chao1 |
| Diversidad β | UniFrac · Bray-Curtis · PCoA |
| Reporte interactivo | HTML con plots dinámicos |
Bacterias y arqueas. Regiones V3-V4, V1-V2 o full-length disponibles.
| Reads | Mín. 100K · óptimo 100–200K / muestra |
|---|---|
| Costo | Más económico |
| TAT | 4–6 semanas |
ITS1/ITS2 para hongos. 18S para eucariontes (protistas, microalgas).
| Reads | Mín. 100K · óptimo 100–200K / muestra |
|---|---|
| Pipeline | DADA2 + UNITE |
| TAT | 4–6 semanas |
Resolución a nivel de gen funcional, cepa y reconstrucción de MAGs.
| Output (taxonómico) | 6 Gb / muestra |
|---|---|
| Output (funcional / genes) | 15 Gb / muestra |
| Pipeline | nf-core/mag · MetaPhlAn |
| TAT | 4–6 semanas |
Cada proyecto de amplicon sequencing 16S/18S/ITS incluye un reporte bioinformático interactivo con preprocessing, taxonomía Bayesiana NCBI, diversidad alpha y beta — listo para publicación o análisis downstream propio.
Recorte de adaptadores y primers en modo error-tolerant. Filtrado por longitud y calidad Q-score. Stats por muestra exportadas a Excel.
Output: trimmed reads + QC_statistics.xlsxDenoising, merge de paired-ends, eliminación de quimeras y construcción de Amplicon Sequence Variants (ASV) con resolución de single-nucleotide.
Output: ASVs_rep.fasta + ASV_table.biom + ASVs_phylo.treAsignación taxonómica vs NCBI 16S DB, métricas alpha (Shannon, Simpson, Chao1, Faith's PD) y beta (PCoA Bray-Curtis · Weighted/Unweighted UniFrac).
Output: heatmaps · barplots · krona · PCoA · UPGMA treesHemos publicado un reporte ASV real generado con nuestro pipeline. Datos ficticios pero estructura idéntica a la que recibirá su proyecto: tablas interactivas, gráficos navegables, descarga de cada output en Excel/BIOM/FASTA.
🆕 Actualización 15 jun 2026
Ahora también puedes personalizar el orden de las muestras (no solo los grupos) en Barplot, Heatmap, Diversity Index, Rarefaction, Distance Matrix y PCoA. Mismo flujo: Group Customization → Download Template → editar Excel → Upload.
Reporte 100% offline · funciona sin internet · ejecuta en cualquier navegador moderno.
Las cantidades mínimas, conservantes y QC varían entre amplicón (16S V3-V4, 16S V1-V2, ITS1, ITS2, 18S V4, 18S V9, Arc, COI) y shotgun (TruSeq Nano META, Nextera XT META), y según el tipo de matriz (heces · saliva · tejido · suelo · agua · sedimento). Consulta los requerimientos validados oficiales en nuestro hub de recursos para evitar rechazos en QC.
Inspecciona tus archivos .fastq.gz antes o después del análisis: estructura de lecturas + histograma Phred (Q30) + contenido GC + calidad por posición estilo FastQC. Sin instalación, sin servidor, gratis.
Reporte reales generados con nuestro pipeline · datos ficticios · diseño idéntico al que recibirá su proyecto.
Reporte interactivo Shotgun metagenomics: clasificación taxonómica Kraken2/Bracken, functional annotation (KEGG/COG), reconstrucción de pathways y MAGs. 100% offline.
Especialista NGS / CES / Síntesis · respuesta en <24 h hábiles desde Madrid o Santiago
España · Portugal · Chile · Perú · Iberoamérica
