Capillary Electrophoresis Sequencing

Sanger · el gold-standard para validación.

Cuando una variante crítica necesita confirmación independiente, Sanger sigue siendo la referencia. 350–1.050 bases por reacción en ABI 3730xl, alta precisión y costo por muestra optimizado.

Promo de lanzamiento · Web ES · PT · CL · PE
10% OFF en tu pedido de Sanger Código SANGER10 · válido hasta el 31 de agosto de 2026 Condición: solicitud web + recepción física de muestras antes del cierre de agosto.
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Descripción

Cuatro líneas de servicio Sanger.

Standard Sequencing · Fragment Analysis · Identification · Customized Sequencing

Macrogen es referencia mundial en Sanger: opera flotas dedicadas de Applied Biosystems 3730xl DNA Analyzer y procesa cientos de miles de reacciones al mes. La oferta cubre desde una secuenciación estándar de un único primer hasta servicios customizados con prep PCR, cloning y pyrosequencing incluidos.

Aplicaciones: validación de variantes NGS, secuenciación de plásmidos, genotipado de microsatélites (fragment analysis), identificación de cepas microbianas y screening dirigido.

Workflow estándar

Reacciones / díaHasta 96 por placa
Read length350–1.050 bases (ABI 3730xl)
Precisión>99% post Q20
TAT en laboratorio24 h desde la recepción de la muestra en el laboratorio de procesamiento (recepciones antes de las 18:00)
TAT total estimado3–5 días hábiles puerta a puerta, incluyendo logística regional
Fragment Analysis5–7 días hábiles
Catálogo Sanger

Cinco productos, un mismo nivel de calidad.

Standard Sequencing

Secuenciación clásica de un primer sobre un template (plásmido o producto PCR purificado). Ideal para verificar clones.

Ver detalle ↓ 📥 Guía de pedido

Identification

Identificación de cepas microbianas (16S/ITS) o especies por barcoding. Incluye análisis BLAST.

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Fragment Analysis

Genotipado de microsatélites (SSR/STR), AFLP, T-RFLP y análisis de longitud de fragmentos con marcadores fluorescentes.

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Customized Sequencing

Tu workflow llave en mano: PCR optimization, cloning, pyrosequencing, MLST y validación de NGS por Sanger.

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★ Nuevo
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Cell Line ID · STR

Autenticación de líneas celulares humanas con PowerPlex Fusion 6c. Reportes ICLAC con matching score vs ATCC y Cellosaurus.

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Necesitas un primer?

96 primers universales en stock — gratis con tu pedido Sanger.

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Servicio 1 de 4

Standard Sequencing.

Secuenciación de productos de PCR y ADN plasmídico sobre sistema automatizado ABI 3730xl. Es el servicio más utilizado del catálogo Sanger y la base sobre la que se construyen el resto de modalidades.

Características del servicio

  • Plataforma ABI 3730xl · read length normal hasta 1.050 bp
  • Resultados en 24 h desde la recepción de la muestra (recepciones antes de las 18:00)
  • Monitoreo en tiempo real vía LIMS, desde la recepción del pedido hasta el envío de resultados
  • Análisis básico gratuito — búsqueda de homología por BlastN / BlastX
  • Primers universales gratuitos — 96 secuencias en stock
  • Re-reacción gratuita en formato tubo individual
  • Gestión post-resultado a cargo de un especialista asignado

Servicios adicionales

  • Purificación de producto PCR (tubo y placa)
  • Extracción desde gel (gel extraction)
  • Picking de clones y extracción de plásmido (tubo / placa / placa de agar)
  • Extracción de BAC / Fósmido / Cósmido
  • Verificación de concentración mediante gel running

Modalidades disponibles

Standard SequencingTubo individual o placa 96 · 1 reacción = 1 template + 1 primer
1 primer / 1 placaPlaca 96 pocillos, un mismo primer en todos los pocillos
1 primer / media placa48 pocillos — ideal para proyectos intermedios
Multi-primer / 1 placaPlaca 96 con 2 a 6 primers distintos
Difficult SequencingTemplates con estructura compleja — ver más abajo
Primer WalkingSecuencias largas de 2–10 kb — ver más abajo
💡 Modalidad Premix Envía el template ya mezclado con el primer en un mismo tubo y accede a la tarifa más económica por reacción. Disponible en tubo y en placa.

Guía de preparación de muestra y primer

Cantidades por reacción, según la guía oficial del sistema de pedidos dna.macrogen.com.

Template Tamaño Concentración Volumen
Producto PCR
purificado o sin purificar
< 200 bp3–5 ng/µLMínimo 10 µL
+5 µL por reacción adicional
200–600 bp5–10 ng/µL
600–1.000 bp10–20 ng/µL
> 1.000 bp20–50 ng/µL
Plásmido100–150 ng/µL
Extracción de gel50–100 ng/µL · > 30 µL
PrimerTM 50–58 °C5–10 pmol/µLMínimo 10 µL
+5 µL por reacción adicional
⚠️ Importante: si la muestra no cumple la concentración recomendada, la reacción de secuenciación no rendirá correctamente. Verifica siempre pureza A260/280 ≈ 1,8 y A260/230 ≈ 2,0 antes del envío.

Difficult Sequencing

Secuenciación de templates con estructuras que bloquean la reacción estándar. Aplicamos condiciones y aditivos específicos para obtener lecturas limpias y reproducibles.

Aplica a: siRNA con estructura hairpin · estructuras secundarias atípicas · regiones G-rich · tractos homopoliméricos (poly-G) · regiones repetitivas GT.

Primer Walking

Para plásmidos o productos de PCR que no pueden leerse en una sola reacción. Se secuencian los extremos y, a partir del resultado, diseñamos y sintetizamos primers internos para extender la lectura.

Rango típico: 2–10 kb · extensión de 500–800 bp por dirección y ronda · aprox. 4 días por ronda de walking. Incluye diseño, síntesis y secuenciación.

Servicio con página propia

Análisis de fragmentos · GeneScan.

Genotipado de microsatélites (SSR/STR), AFLP, T-RFLP y MSI por electroforesis capilar, con primers marcados del mismo proveedor y TAT de 5–7 días hábiles. Modalidades en tubo y placa con LIZ 600/1200.

Ver análisis de fragmentos →
Servicio con página propia

Identificación bacteriana y fúngica.

16S, ITS, 18S y 26S en paquete: PCR con primers universales, secuenciación, análisis BLAST, taxonomía completa y árbol filogenético. Más de 1.350 bp garantizados en 16S y reporte listo para publicar.

Ver identificación 16S →
Servicio 4 de 4

Customized Sequencing.

Cuando el flujo estándar no basta. Servicios llave en mano que combinan preparación de muestra, PCR, cloning, pyrosequencing y validación — diseñados sobre las necesidades específicas de tu proyecto.

PCR Optimization / Amplification

Proceso completo a partir de células o gDNA con su referencia: diseño de primers, amplificación por PCR, secuenciación y reporte bioinformático.

Incluye touch-down PCR, nested PCR y PCR sobre FFPE — especialmente útil cuando la especificidad de la muestra genera altas tasas de re-experimentación. Se realiza pre-test antes del procesamiento masivo. Extracción de gDNA disponible desde muestras animales, vegetales e insectos.

Pyrosequencing

Determinación de secuencia mediante detección del pirofosfato (PPi) liberado durante la polimerización. Referencia para análisis cuantitativo de metilación del ADN.

Aplicaciones: estudios de metilación · análisis de SNP e InDel · investigación en cáncer (detecta frecuencias alélicas bajas, <5%; apto para mutación somática y análisis di-, tri- y tetra-alélico) · validación de resultados NGS y verificación de biomarcadores/GWAS.

NGS Validation

Verificación por Sanger de variantes detectadas por NGS, para elevar la precisión y confiabilidad del dato. Analizamos SNPs y mutaciones en posiciones específicas a partir de la posición cromosómica o secuencia de referencia.

Servicio one-stop si tu NGS también se procesó en Macrogen: recibimos la muestra directamente. Incluye diseño de primers, secuenciación y análisis comparativo de variantes. Opcional: comparación contra control normal y verificación con dos sets de primers sobre la misma región.

MLST · Multilocus Sequence Typing

Clasificación de cepas dentro de una misma especie de bacterias u hongos mediante la secuenciación de 5 a 7 genes housekeeping.

Analiza la relación entre Sequence Types (ST) y, mediante la combinación de alelos por cepa, permite establecer relaciones evolutivas genéticas y moleculares dentro de la especie.

Cloning

Aislamiento y replicación masiva de un gen o fragmento específico. Insertamos tu producto de PCR en un vector proporcionado por Macrogen (T-vector o blunt-vector) o en tu propio vector (sub-cloning).

Especialmente útil cuando existe más de un producto de PCR en la muestra: en ese escenario la secuenciación directa no entrega resultados limpios, y el cloning resuelve el problema además de permitir replicación masiva y almacenamiento estable.

One-click Sanger Sequencing

Análisis de variantes en genes específicos ampliamente estudiados, con un flujo preconfigurado que va desde la extracción de gDNA hasta el análisis de SNP.

Utiliza sets de primers optimizados por nuestro equipo para secuenciar exones concretos y entregar directamente el resultado de análisis de variantes.

96 primers en stock · gratis con Sanger

Primers universales incluidos.

M13, T7, SP6, T3, BGH, CMV, EGFP, AOX1, ITS1–5, 16S (27F/1492R), COI y muchos más. Si tu primer está en la lista, no necesitas enviarlo: lo aplicamos sin coste a tu reacción.

Buscar en los 96 primers →
Servicio con página propia

Cell Line ID · autenticación STR.

PowerPlex Fusion 6c con matching contra ATCC y Cellosaurus según el estándar ICLAC. Requisito de revistas como Nature o Cell; TAT 3–4 días hábiles y 99,99% de precisión.

Ver Cell Line ID →
Logística de envío

Cómo enviar tus muestras Sanger.

Pick-up gratis en Madrid 🇪🇸 y Santiago 🇨🇱. Para envíos internacionales, descarga la etiqueta correspondiente al hub que te atiende.

🇨🇱
Hub Santiago

Macrogen Chile

Magdalena 140, Of. 401
Las Condes, Santiago. 7550104.
🇨🇱 Chile
+56 9 5845 1395

Sirve a Chile y Perú · USD invoicing · pick-up gratis en Santiago

🖨️ Imprimir etiqueta Sanger →
🇪🇸
Hub Madrid

Macrogen Spain

C. de Martínez Villergas, 52
28027 Madrid
🇪🇸 España
+34 911 138 378

Sirve a España y Portugal · EUR invoicing · pick-up gratis en Madrid

Ver contactos hub Madrid →

Protocolo de preparación antes del envío

Seguir estos pasos asegura que tus muestras lleguen en óptimas condiciones y mejora directamente la calidad de la secuenciación.

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Formato tubo

Producto PCR / ADN plasmídico

  1. Purifica tu muestra — o contrata nuestro servicio de purificación enzimática.
  2. Mide la concentración: mínimo 100 ng/µL y máximo 300 ng/µL. Para ADN plasmídico, se recomienda entre 100–200 ng/µL.
  3. Verifica la pureza: A260/280 ≈ 1,8 y A260/230 ≈ 2,0.
  4. 15 µL de muestra por reacción. Ejemplo: muestra 1 + primer Fw + primer Rv = 2 reacciones → 30 µL a enviar.
  5. Rotula la tapa del tubo con el nombre de la muestra y coloca parafilm para evitar evaporación o derrames en el transporte.
  6. Prepara los partidores considerando 1,5 µL por reacción, a una concentración de 10 pmol/µL.
  7. Empaca con la etiqueta del número de orden HCXXXXXXXX.
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Formato placa

Placa de 96 pocillos

Permite enviar muchas reacciones organizadas en un solo formato, procesadas de forma automatizada, consistente y a menor costo por reacción.

  1. Ajusta las concentraciones de gDNA para obtener bandas claras y limpias tras la PCR.
  2. Purifica la muestra para evitar problemas por contaminantes como proteínas, sales o fenoles.
  3. Envía primers a 10 pmol y ADN entre 100–300 ng/µL, verificando A260/280 y A260/230 ≈ 1,8–2,0.
  4. Coloca 20 µL por pocillo, respetando las coordenadas A1–H12. Es crítico que el orden de la placa coincida con el registrado en el sistema, para evitar errores de trazabilidad.
  5. Evita adhesivos de sellado que puedan causar derrames o filtraciones entre pocillos. Prefiere strip caps o heat seal.
📦 ¿Cómo coordinar el envío? Para envíos por FedEx o DHL consulta nuestras guías en la página de Recursos — incluyen procedimientos con y sin hielo seco, tarifas y declared price recomendado (USD 10-100 para evitar inspección aduanal). Para volúmenes grandes (>20 reacciones Sanger), el envío es gratuito.
Ventajas Sanger Chile

5 diferenciadores que protegen tu investigación.

Cada proyecto tiene requerimientos diferentes. Adaptamos el servicio a tu volumen y presupuesto.

Ahorro con Primers Universales gratis

Más de 90 primers de stock sin cargo adicional: T7, T3, M13F/R, 27F, 1492R, 518F, 785F, ITS1–5, NS1/NS8, LR0R/LR7, pET, pGEX, pBAD, EGFP-C y muchos más. Lista completa disponible por correo.

Modalidad Premix · mayor ahorro

Entrega tus muestras premezcladas con el primer (Premix) y accede a una tarifa aún más económica por reacción o por placa. Optimiza tiempo y presupuesto.

Purificación enzimática de ADN

Altamente recomendada para eliminar remanentes de PCR. Garantiza máxima resolución y lecturas limpias con cromatogramas listos para publicación.

Garantía de tranquilidad (tubos)

Para tu total seguridad, si algo falla en el formato de tubos estándar, cuentas con el beneficio de resecuenciación gratuita para proteger el avance de tu investigación.

Eficiencia en grandes volúmenes (placas)

¿Proyectos de gran escala? Optimiza drásticamente tu presupuesto con el formato de placas de 96 pocillos para abaratar el costo por reacción.

Protocolo Macrogen

🔬 Materiales y Métodos.

Protocolo oficial actualizado · 2025. Mismo workflow en los dos hubs (Madrid + Santiago) — la única diferencia es la moneda de facturación.

Reactivos & equipamiento

🧬 Muestra20–100 ng / reacción
🔧 SecuenciadorABI PRISM 3730xl (96 capilares)
🧫 KitBigDye® Terminator v3.1 (Applied Biosystems)
🧲 Purificación PCRExoSAP-IT™ Express (ThermoFisher)
🌡️ TermocicladorDNA Engine Tetrad 2 Peltier (BIO-RAD)
💻 AnálisisVariant Reporter v2.1 · DNASTAR Lasergene SeqMan 7.0
🔬 Extracción gDNAInstaGene Matrix (BIO-RAD) / Exgene Tissue SV
📊 ElectroforesisAgarosa 1,5% · 300V · 200A · 20 min

Condiciones PCR

Paso PCR Temp Tiempo Ciclos
Desnaturalización inicial95 °C5 min
Desnaturalización95 °C30 seg35×
Anillamiento55 °C30 seg
Extensión72 °C1 min
Extensión final72 °C7 min
Almacenamiento4 °C
📋 Validación Cada lote de reactivos pasa control de calidad interno. Cromatogramas listos para publicación. Análisis BlastN incluido sin costo para identificación de secuencias.
📥 Descargar protocolo completo (PDF)
Respaldo tecnológico

Cuatro garantías incluidas en cada pedido.

⚡ TIEMPOS DE RESPUESTA

24–48 horas tras recepción

TAT competitivo desde Madrid y Santiago. Resultados disponibles vía portal LIMS.

📊 TRAZABILIDAD ABSOLUTA

Plataforma LIMS

Monitoreo en tiempo real del estado de sus solicitudes desde el portal seguro.

🧠 ANÁLISIS COMPLEMENTARIO

BlastN sin costo

Análisis BlastN automático para identificación de secuencias — incluido sin cargo.

📦 LOGÍSTICA SIN COSTO

Envío gratis + recogida

Envío gratuito para órdenes >20 reacciones (DHL/FedEx) · pick-up gratis en Madrid + Santiago.

Tarifas Iberoamérica

Precios transparentes para planificar tu presupuesto.

🇨🇱 Chile · Perú: facturación en USD exenta de IVA  ·  🇪🇸 España · Portugal: facturación en EUR (IVA según país UE)

Servicio Formato USD 🇨🇱🇵🇪 EUR 🇪🇸🇵🇹
Premix TubeTubo$4,5 / muestra€4,2 / muestra
Standard-seq en tubosTubo$5 / reacción€4,7 / reacción
Premix PlatePlaca 96 pocillos$259 / placa€242 / placa
Standard-seq Plate · 1 primerPlaca 96 pocillos$299 / placa€279 / placa
Standard-seq media placa · 1 primerMedia placa 48 pocillos$139 / placa€130 / placa
Standard-seq Multi-primer (2–6)Placa 96 pocillos$350 / placa€327 / placa
Purificación enzimáticaPor muestra (tubo)$2 / muestra€1,9 / muestra
Purificación enzimáticaPor placa$100 / placa€94 / placa
📦 Envío y logística Sanger: Tarifa de envío $25 USD / €25 EUR. GRATIS para pedidos superiores a $100 USD / €100 EUR. Pick-up GRATIS en 🇪🇸 Madrid y 🇨🇱 Santiago.
Las tarifas pueden variar según servicio, formato y destino. Confirma siempre el costo exacto en tu cotización.
💼 GRANDES VOLÚMENES

¿Proyecto recurrente o >500 reacciones?

Nuestros precios pueden ajustarse para proyectos de gran volumen. Contacta al representante de ventas para una cotización personalizada con descuentos.

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