Resuelve la heterogeneidad celular que se pierde en bulk sequencing. Plataforma 10x Genomics Chromium operada por Certified Service Provider.
Single Cell Sequencing permite analizar el transcriptoma, accesibilidad cromatínica o repertorio inmune de cada célula individual dentro de una muestra. Donde antes veíamos un promedio, ahora vemos cientos de tipos celulares con identidades únicas.
Operamos la plataforma 10x Genomics Chromium con todos sus assays: Single Cell Gene Expression, Single Cell Multiome (RNA + ATAC), Single Cell Immune Profiling y Single Cell ATAC.
Aplicaciones: oncología (TME), inmunología, neurociencias, biología del desarrollo, atlas celulares de tejidos.
| FASTQ por librería | Cell Ranger compatible |
|---|---|
| Matriz cells × genes | 10x format · h5 + Loom |
| Pre-procesamiento | Cell Ranger / Cell Ranger ATAC |
| Análisis Seurat / Scanpy | QC, normalización, clustering, UMAP |
| Annotation | SingleR · Azimuth · markers |
| Reporte HTML | Interactivo · explorable |
El estándar para perfilado transcriptómico. ~10.000 células / canal, 50.000 reads/célula.
Mapeo de accesibilidad cromatínica para inferir actividad regulatoria por célula.
RNA + ATAC en la misma célula — la información más completa por experimento.
TCR/BCR + transcriptoma para caracterización completa de células T y B.
Transcriptoma con coordenadas espaciales en cortes histológicos.
Para muestras fijadas con formaldehído o FFPE recientes.
| Tipo | Suspensión celular fresca · núcleos aislados · células fijadas |
|---|---|
| Concentración | 700–1.200 células/µL |
| Viabilidad | ≥80% (ideal ≥90%) |
| Volumen mín. | 30 µL |
| Buffer | PBS + 0.04% BSA o equivalente |
| Tiempo crítico | Procesar dentro de 4h post-disociación |
¿Necesitas asesoría en disociación o coordinación con el envío fresco a Santiago? Nuestro equipo puede ayudarte a planificar el día del experimento.