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Centro de ayuda

Preguntas frecuentes

Respuestas rápidas a las preguntas más comunes sobre logística, preparación de muestras, conceptos técnicos y servicios de Macrogen Iberoamérica.

Mostrando todas las 39 preguntas

1 Logística y tiempos de entrega

¿Cuál es el tiempo de entrega (TAT) para servicios de NGS?

El tiempo de procesamiento estándar es de 4 a 7 semanas, dependiendo de la complejidad del proyecto y el tipo de librería.

¿Cuánto tarda el envío de las muestras a Corea?

El tránsito internacional suele demorar aproximadamente 3 días hábiles.

¿Con qué empresas de transporte trabaja Macrogen?

Utilizamos servicios de mensajería global líderes como FedEx y DHL para garantizar la seguridad de la cadena de frío.

¿Cuál es el coste de envío de las muestras?

El coste de envío depende del tipo de servicio:

Servicio Tarifa de envío Envío GRATIS si pedido >
🧬 NGS (WGS, WES, RNA-Seq, Single Cell, Metagenoma, Epigenoma)$100 USD / €100 EUR$1.000 USD / €1.000 EUR
🧪 Sanger / CES$25 USD / €25 EUR$100 USD / €100 EUR
⚗️ Oligo synthesis (DNA + RNA)$25 USD / €25 EUR
🔬 Gene synthesis$45 USD / €45 EUR (shipping + handling)

⚠️ Las tarifas de envío pueden variar según el servicio específico, destino, formato de la muestra (con/sin hielo seco) y volumen. Confirma siempre el coste exacto al recibir tu cotización.

💡 Pick-up gratuito disponible en Madrid 🇪🇸 y Santiago 🇨🇱 para laboratorios locales (sin coste de envío).

📦 Proyectos de gran volumen

Nuestros precios pueden ajustarse para proyectos de gran volumen. Contacta a tu representante comercial para obtener una cotización personalizada y descuentos por volumen: info-spain@macrogen.com (🇪🇸 ES/PT) o info-chile@macrogen.com (🇨🇱 CL/PE).

¿Tienen servicio de pick-up gratis?

Sí, en ambos hubs:

Para muestras fuera de las ciudades de Madrid o Santiago, usa nuestras guías de envío con Chilexpress, DHL o FedEx (envío gratuito sobre 100 EUR / 100 USD de pedido).

En España, coordinamos retiros desde tu laboratorio vía DHL o FedEx. Contacta a info-spain@macrogen.com para coordinar.

¿Hay un día recomendado para enviar muestras?

Sí. Se recomienda realizar los envíos los días lunes o martes para evitar que el paquete quede retenido en aduanas o en tránsito durante el fin de semana. Esto es especialmente crítico para muestras de RNA enviadas con hielo seco.

Para envíos urgentes, contáctanos antes para coordinar.

2 Preparación y envío de muestras

¿Cómo debo enviar muestras de RNA?

Para prevenir la degradación, las muestras de RNA deben enviarse obligatoriamente en hielo seco. Se recomienda realizar el envío los días lunes o martes para evitar que el paquete quede retenido en aduanas durante el fin de semana.

Consulta los criterios de calidad detallados (SQC) en la sección "¿Dónde puedo encontrar las guías de envío y requerimientos técnicos?" más abajo.

¿Dónde puedo encontrar las guías de envío y requerimientos técnicos?

Las guías de envío están organizadas por tipo de muestra, región y empresa de transporte. Las muestras de DNA se envían sin hielo seco, las de RNA con hielo seco.

Guías de envío DNA — sin hielo seco

🇪🇸 España

📦 DHL · sin hielo seco 📦 FedEx · sin hielo seco

🇨🇱 LATAM (Chile / Perú) — próximamente

Guías de envío RNA — con hielo seco

🇪🇸 España

❄️ DHL · con hielo seco ❄️ FedEx · con hielo seco

🇨🇱 LATAM (Chile / Perú) — próximamente

Requerimientos de librerías — criterios SQC por tipo de secuenciación

🧬 Short Read Sequencing (SRS) 🧬 Long Read Sequencing (LRS)
¿Cómo me registro en el sistema de Macrogen?

Puedes gestionar tus pedidos y revisar resultados creando una cuenta en dna.macrogen.com. La guía de registro paso a paso está disponible aquí:

👤 Guía de registro de usuario
¿Cómo debo preparar mis muestras de DNA?

Las muestras de DNA deben cumplir los siguientes criterios para garantizar resultados óptimos:

  • Buffer: tampón TE comercial o agua tratada con DEPC (diethyl pyrocarbonate)
  • Concentración mínima: 50 ng/μL
  • Volumen mínimo: 10 a 15 μL
  • Pureza: ratio A260/280 entre 1.7 y 2.0
  • Calidad: doble cadena, no degradado, sin partículas en suspensión
  • Purificación: protocolo de columna o gel

Etiqueta los tubos (microcentrifuge 1.5–2.0 mL o placas de 96 pocillos) con marcador permanente, sella con parafilm, y los IDs deben coincidir con la hoja de pedido.

¿Cuáles son los criterios de calidad (QC) para muestras de RNA?

Las muestras de RNA tienen requisitos más estrictos por su mayor degradabilidad:

  • Buffer: agua tratada con DEPC (preferido). La precipitación con etanol es posible pero no recomendada para cantidades pequeñas.
  • Concentración mínima: 50–100 ng/μL (depende del servicio)
  • Volumen: 10 μL mínimo
  • RIN (RNA Integrity Number): ≥ 7 (medido con Agilent Bioanalyzer)
  • Pureza: A260/280 entre 1.9 y 2.1
  • Envío: obligatorio en hielo seco

Como alternativa al hielo seco, puedes usar reactivos estabilizadores de RNA (ej. RNAlater) — indícalo en la sección de comentarios del pedido.

Consulta los criterios SQC detallados:

🧬 SQC Short Read Sequencing 🧬 SQC Long Read Sequencing
¿Qué métodos usa Macrogen para QC de muestras?
  • DNA: cuantificación por fluorescencia (Qubit) y pureza por absorbancia A260/280 (espectrofotómetro NanoDrop)
  • RNA: cuantificación por fluorescencia + medición del RIN (RNA Integrity Number) con Agilent Bioanalyzer
  • Librerías Illumina: tamaño de fragmento por Bioanalyzer (chip DNA 1000) + cuantificación por qPCR según el protocolo Illumina, garantizando densidad de cluster óptima en cada flow cell
¿Cómo verifico la integridad de los archivos descargados?

Cada entrega de datos NGS incluye valores MD5 checksum en el reporte. Para verificar integridad:

  1. Descarga los archivos desde el link FTP seguro proporcionado
  2. NO descomprimas los archivos inmediatamente
  3. Calcula el MD5 de cada archivo descargado (en Linux/Mac: md5sum archivo.fastq.gz; en Windows PowerShell: Get-FileHash archivo.fastq.gz -Algorithm MD5)
  4. Compara con el MD5 indicado en el reporte

Si los valores coinciden, no hay corrupción ni manipulación durante la transferencia.

3 Definiciones y conceptos técnicos

¿Qué diferencia hay entre Short Reads y Long Reads?
  • Short Reads (Illumina): Lecturas cortas de alta precisión, ideales para identificar variantes genéticas (SNPs) y análisis de expresión (RNA-Seq).
  • Long Reads (PacBio / Nanopore): Lecturas largas esenciales para ensamblajes de novo de genomas complejos y detección de variantes estructurales.
¿Cuál es la diferencia entre WES y WGS?
  • WGS (Whole Genome Sequencing): Secuenciación de todo el ADN del organismo, incluyendo regiones codificantes y no codificantes (intrones, promotores).
  • WES (Whole Exome Sequencing): Se enfoca solo en los exones (regiones que codifican proteínas), siendo la opción más eficiente para identificar variantes clínicas conocidas.
¿Cuál es el tiempo de entrega para secuenciación Sanger (CES)?

Los resultados de CES se entregan en un plazo de 24 horas tras la recepción de la muestra en nuestras instalaciones (servicio EZ-Seq).

¿Qué plataformas de secuenciación utilizan?

Operamos exclusivamente las plataformas autorizadas para la operación Macrogen Iberoamérica:

  • Short reads (Illumina): NovaSeq X Plus y MiSeq i100
  • Long reads (PacBio): PacBio Revio
  • Long reads (Oxford Nanopore Technologies): ONT PromethION
  • Sanger / CES: Applied Biosystems 3730xl DNA Analyzer

La plataforma se selecciona automáticamente según el servicio que solicites. Si tienes preferencia específica, indícalo en tu pedido.

¿Qué longitud de lectura ofrece Sanger?

Nuestro ABI 3730xl DNA Analyzer entrega lecturas en el rango de 350–1.050 bases por reacción, dependiendo de la calidad de la muestra y el largo del template.

  • Read length efectivo: hasta ~1.050 bases en condiciones óptimas
  • Calidad Q20+: en más de 650 bases
  • Mínimo confiable: 350 bases incluso con templates difíciles
¿Qué concentración de PCR debo enviar para Sanger?

La regla general de Macrogen es 10 ng/µL por cada 100 bases del producto PCR. En la práctica:

Tamaño del PCR Concentración mínima
PCR < 600 bp≥ 30 ng/µL
PCR > 600 bp≥ 60 ng/µL
Plásmido200–500 ng/µL

El producto PCR debe estar purificado (idealmente con purificación enzimática) con A260/280 ≥ 1.8. Volumen mínimo: 5 µL. Si tienes muestras de baja concentración, consulta primero con nuestro equipo técnico — podemos optimizar el protocolo.

📋 Más detalles en la página de Sanger / CES →

¿Qué tecnologías de captura de exoma utilizan?

Para WES (Whole Exome Sequencing) ofrecemos los principales kits de captura del mercado:

  • Agilent SureSelect Exome Capture Kit (estándar de oro)
  • Illumina TruSeq Exome Enrichment Kit
  • Twist Human Core Exome Kit

Si tienes una preferencia o requerimiento específico, indícalo al solicitar tu cotización.

4 Metagenómica · amplicones vs shotgun

¿Qué es la metagenómica por amplicones?

Se basa en la construcción de librerías dirigidas a grupos específicos (bacterias, hongos o arqueas) mediante la amplificación de regiones conservadas (ej. 16S o ITS).

Es la opción ideal para proyectos dirigidos donde se busca identificar la composición taxonómica de un grupo concreto. Por ejemplo, con 16S solo recibirás lecturas de bacterias.

¿Qué es la metagenómica shotgun?

Se secuencian de forma "general" todos los fragmentos de ADN presentes en la muestra, sin importar el reino (bacterias, hongos, virus, etc.). Proporciona una visión global.

Muy utilizada en muestras ambientales para conocer preliminarmente qué organismos están presentes. Ideal para estudios comparativos.

Amplicones disponibles en stock (primers)

Ofrecemos los siguientes primers estándar sin coste adicional de síntesis:

Región objetivo Secuencia FWD (5' → 3') Secuencia REV (5' → 3')
16S V3-V4CCTACGGGNGGCWGCAGGACTACHVGGGTATCTAATCC
16S V1-V2GAGTTTGATCMTGGCTCAGGCTGCCTCCCGTAGGAGT
ITS1-ITS2CTTGGTCATTTAGAGGAAGTAAGCTGCGTTCTTCATCGATGC
ITS3-ITS4GCATCGATGAAGAACGCAGCTCCTCCGCTTATTGATATGC
Arc 21F-516RTCCGGTTGATCCYGCCGGGGTDTTACCGCGGCKGCTG
Arc 787F-1059RATTAGATACCCSBGTAGTCCGCCATGCACCWCCTCT
18S V4F-V4RCCAGCAGCCGCGGTAATTCCACTTTCGTTCTTGATTAA
18S V9F-V9RCCCTGCCHTTTGTACACACCCTTCYGCAGGTTCACCTAC
COI 1TATAGCATTCCCACGAATAAATAATAAACTTCAGGGTGACCAAAAAATCA
COI 2GGWACWGGWTGAACWGTWTAYCCYCCTAAACTTCAGGGTGACCAAAAAATCA
¿Puedo usar mis propios primers (custom primers)?

Sí, es posible realizar el servicio con primers personalizados con un coste adicional de 100 EUR por proyecto.

5 Pago y facturación

¿Qué métodos de pago aceptan?

Aceptamos los siguientes métodos:

  • Transferencia bancaria (Telegraphic Transfer)
  • Tarjeta de crédito (Visa o MasterCard)
  • Prepago (depósito anticipado, recomendado para clientes recurrentes)

La moneda de facturación depende del hub que te atiende:

  • 🇪🇸 España / Portugal / UE → factura en EUR emitida por Macrogen Spain S.L. (Madrid). IVA aplicable según país.
  • 🇨🇱 Chile / Perú / LATAM → factura en USD emitida por Macrogen Chile SpA (Santiago). Exenta de IVA en Chile.
  • 🌎 Otros países → factura en USD, EUR, JPY o GBP según acuerdo. La moneda se confirma en la cotización antes del pedido.
¿Cuáles son los términos de pago?

Nuestros términos estándar son NET 30 días. La factura se emite tras la entrega de los datos o el envío del producto, y debe pagarse dentro de 30 días desde la fecha de emisión.

Si el pago no se realiza dentro del plazo, se aplica una penalización del 10% anual sobre el saldo pendiente, salvo acuerdo escrito previo.

¿Cuándo se aplica el IVA en mi factura?

Importante para facturación España: los servicios estándar de NGS no llevan IVA. El IVA del 21% se desglosa y se cobra únicamente en el servicio de CES (Sanger Sequencing).

Reglas aplicables por país y por servicio:

  • Servicios NGS (WGS · WES · RNA-Seq · Single Cell · Metagenómica · Epigenoma · Microarray · Bioinformática): sin IVA para cualquier cliente UE o extra-UE.
  • Servicio CES (Sanger) · clientes en España (y resto UE sin VIES válido): se aplica 21% IVA.
  • Servicio CES (Sanger) · clientes UE con VIES válido (fuera de España): sin IVA (operación intracomunitaria).
  • Clientes fuera de la UE (Chile, Perú, otros): facturación exenta de IVA en todos los servicios.

Si tienes dudas sobre tu caso específico, contáctanos antes de realizar el pedido.

¿Puedo cambiar la información de facturación de una factura ya recibida?

Sí, pero requiere notificación previa. Contacta:

Cuanto antes notifiques el cambio, más fácil será procesarlo.

¿Cuánto tiempo tengo para reclamar sobre los resultados?

Tienes 10 días hábiles desde la recepción de los resultados o productos para inspeccionarlos y notificar cualquier defecto o problema. Si no recibimos notificación dentro de este plazo, los resultados se consideran aceptados sin defectos.

Si hay un problema válido (ej. error técnico nuestro), repetimos el análisis sin costo adicional. Si el problema se debe a la muestra del cliente (ej. degradación), el costo del re-análisis lo asume el cliente.

¿Tienen política de prepago o créditos?

Sí. Puedes realizar un depósito anticipado y consumirlo a medida que solicitas servicios. Esto es ideal para laboratorios con flujo recurrente de pedidos.

Vigencia del saldo prepago: el saldo expira a los 5 años tras el último uso. Este periodo es dinámico — cada uso actúa como una renovación del plazo de caducidad, reiniciando el contador de 5 años desde ese momento.

Ejemplo: si depositas el saldo en enero 2026 y haces un pedido en agosto 2028, el contador se reinicia desde agosto 2028 y tu saldo queda vigente hasta agosto 2033.

Para coordinar un prepago, contacta a tu hub correspondiente.

6 Servicios disponibles

¿Qué servicios de NGS ofrecen?

Nuestro catálogo NGS incluye:

  • Whole Genome Sequencing (WGS): de novo y resequencing
  • Whole Exome Sequencing (WES): con kits Agilent, Illumina, Twist
  • Transcriptome Sequencing: mRNA, mRNA+lncRNA, Single Cell RNA, Small RNA, Iso-Seq
  • Targeted Sequencing: paneles personalizados
  • Metagenome Sequencing: amplicones (16S, 18S, ITS, COI) y shotgun
  • Epigenome Sequencing: WGBS, RRBS, Methyl-Capture, ChIP-seq
  • Spatial Transcriptomics: Visium, GeoMx
  • Single Cell: 10x Genomics Chromium (3' GEX, 5' GEX, V(D)J)

Consulta el catálogo completo en servicios.

¿Qué tipos de servicios Sanger (CES) ofrecen?

Nuestra línea CES cubre 6 productos:

  • Sequencing Service — secuenciación estándar
  • Customized Sequencing — flujos a medida (PCR + cloning + secuenciación)
  • Identification — identificación de cepas (16S/ITS) con análisis BLAST
  • Fragment Analysis — STR, AFLP, MLPA, microsatélites
  • PyroSequencing — secuenciación por pirofosfato
  • Cloning — clonación de productos PCR
¿Hacen síntesis de oligonucleótidos?

Sí. Sintetizamos oligonucleótidos a múltiples escalas y purificaciones, con todas las modificaciones químicas estándar:

  • Escalas: 25 nmol → 10 μmol (incluyendo gBlocks de hasta 3.000 bp)
  • Purificación: desalado, HPLC, PAGE
  • Fluoróforos: FAM, HEX, TET, Cy3, Cy5, Texas Red
  • Quenchers: BHQ-1, BHQ-2, TAMRA, MGB
  • Modificaciones funcionales: biotina, amino-link, tiol, fosforilación
  • Modificaciones internas: LNA, 2'-O-Me, deoxyU, dSpacer

Para sondas TaqMan, Molecular Beacons y FRET ofrecemos purificación HPLC estándar.

¿Qué servicios Long Read tienen disponibles?

Operamos las dos principales tecnologías long-read del mercado:

  • PacBio HiFi (Revio): lecturas largas de alta fidelidad (>99.9% Q30, 15-20 kb). Ideal para ensamblajes de novo, variantes estructurales, full-length 16S rRNA, Iso-Seq, metilación.
  • Oxford Nanopore Technology (ONT): tecnología ONT para aplicaciones específicas como long-read RNA-Seq, detección de modificaciones epigenéticas en tiempo real, secuenciación rápida portátil.
¿Ofrecen análisis bioinformático?

Sí. Cada servicio NGS incluye análisis bioinformático estándar con pipelines validados:

  • Variant calling (GATK Best Practices, DeepVariant, Mutect2)
  • Análisis de expresión diferencial (DESeq2, edgeR, limma)
  • Single Cell (Seurat, Scanpy, anotación con SingleR/Azimuth)
  • Microbioma (DADA2, QIIME2, MetaPhlAn4)
  • Epigenética (Bismark, methylKit, MACS3)

También ofrecemos análisis a medida y reanálisis de datos existentes. Consulta nuestra página de bioinformática.

7 Resultados y datos

¿En qué formato recibo mis resultados?

Los formatos de entrega varían según el servicio:

  • Sanger / CES: AB1 (cromatograma raw con quality score), SEQ (texto plano), PHD (quality score), PDF (visualización). Comprimidos en ZIP.
  • NGS — datos crudos: FASTQ (R1 + R2 por muestra), comprimidos con gzip
  • NGS — alineamiento: BAM ordenado e indexado, BedGraph, BED peaks (según servicio)
  • NGS — variantes: VCF anotado (VEP / SnpEff con ClinVar, gnomAD, dbSNP)
  • RNA-Seq: matrices de cuentas (raw, TPM, FPKM), reporte HTML interactivo con PCA, volcano plots, heatmaps, enriquecimiento GO/KEGG
  • Reporte ejecutivo: PDF en español resumiendo metodología y resultados clave
¿Por cuánto tiempo guardan mis muestras y datos?

Política de almacenamiento estándar (sin solicitud especial del cliente):

ServicioMuestrasDatos
CES (Sanger)90 días calendario3 años
OligoN/A3 años
NGS90 días calendario30 días calendario
Clínico90 días calendario90 días calendario
Microarray90 días calendario90 días calendario

Tras estos plazos, las muestras y datos se eliminan automáticamente. Si necesitas almacenamiento extendido, indícanoslo antes del envío (puede tener costo adicional).

Vigencia del enlace de descarga: 2 semanas a partir de su generación.
Retención / almacenamiento de datos: 30 días naturales en servidor antes del borrado automático.

¿Cómo descargo mis resultados NGS?

Tras la finalización del análisis, recibirás un email con un enlace seguro de descarga válido por 2 semanas desde su generación. Los resultados están disponibles en el portal global dna.macrogen.com con tu cuenta corporativa.

Retención de datos: los datos se mantienen en servidor durante 30 días naturales tras la entrega, antes del borrado automático. Recomendamos descargar inmediatamente.

Formatos entregados: FASTQ (raw reads), BAM (alineamiento), VCF (variantes), informes PDF de QC y resumen ejecutivo. Para WGS/WES típicamente 50-200 GB por muestra — recomendamos descarga directa al servidor de tu institución.

¿Ofrecen soporte bioinformático posterior?

Sí. Nuestro equipo de bioinformática en Madrid y Santiago ofrece soporte de interpretación, repipelining custom (GATK, DRAGEN, isaac4) y consultoría de análisis avanzado (variant calling, annotación, single-cell). Solicita una cotización personalizada desde contacto.

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