Recursos para tu laboratorio.

Guía de pedido · Standard Sequencing

Cómo cotizar y registrar pedidos de secuenciación Sanger estándar (Premix, EZ-Seq, Eco-Seq) en el portal dna.macrogen.com paso a paso.

Guía de pedido · Customized Sequencing

Servicios customizados Sanger: secuenciación a partir de colonias/glycerol stock, BAC, PAC, plásmidos largos, repeats, GC-rich y secondary structures.

Guía de pedido · Fragment Analysis

Cómo enviar muestras para Fragment Analysis (microsatélites/STR, genotipado, MLPA): elección de tube/plate, run type, size markers y additional services.

Guía de pedido · Cell Line ID (STR)

Autenticación de líneas celulares humanas con PowerPlex Fusion 6c en ABI 3730xl. Reportes ICLAC con matching score vs ATCC/Cellosaurus.

Guía de pedido · Identification (16S/18S/ITS/26S)

Cómo cotizar y registrar pedidos de identificación molecular: bacterias (16S 27F/1492R), hongos (18S NS1/NS24, ITS5/ITS4, 26S LR0R/LR7), análisis BlastN incluido.

Sample Report · 16S rRNA Identification

Ejemplo de reporte estándar BI-REPORT entregado al cliente: cromatograma, secuencia consenso, NCBI BLAST hits, % identity y especies más similares. Versión 2025.

Macrogen NGS OrderSheet

Planilla Excel oficial para coordinación de pedidos NGS: información del cliente, datos del proyecto, listado de muestras, servicio solicitado (WGS/WES/RNA-Seq/Single Cell/etc.), volumen, concentración y QC. Imprescindible junto al envío de muestras.

Sample Delivery Guide

Guía oficial de entrega de muestras: requerimientos de calidad por servicio, formato de tubos/placas, etiquetado, condiciones de transporte (RT vs frío vs dry-ice) y checklist pre-envío. Aplicable a Madrid y Santiago.

Guía de registro en el portal

Paso a paso para crear tu cuenta en dna.macrogen.com: verificación de email institucional, asignación a tu institución, configuración de facturación y permisos para invitar a colaboradores del laboratorio.

How to find a reference

Cómo seleccionar el genoma de referencia correcto para tu análisis NGS: bases de datos (NCBI, Ensembl, UCSC, GENCODE), versiones (GRCh38 vs T2T-CHM13), build patches y cómo informarlo en el OrderSheet para análisis bioinformático.

Protocolo PCR & Sequencing

Protocolo oficial para amplificación PCR previa a Sanger sequencing: condiciones de annealing, número de ciclos, dilución del producto, recomendaciones por tamaño de amplicón.

Criterios SQC · Short Read Sequencing

Sample Quality Criteria oficiales para librerías SRS (Illumina): cantidad, concentración, DIN/RIN, A260/280, A260/230. Aplica a WGS, WES, RNA-Seq, single cell.

Criterios SQC · Long Read Sequencing

Sample Quality Criteria para librerías LRS (PacBio Revio, Oxford Nanopore): tamaños mínimos de DNA, criterios extra de integridad, evitar shearing.

96 Primers Universales · Macrogen Chile

Listado oficial v3 con los 96 primers universales en stock (M13, T7, SP6, T3, BGH, CMV, EGFP, AOX1, ITS1-5, 16S 27F/1492R, COI, etc.). Incluidos gratis con cualquier pedido Sanger CES — no necesitas enviar tu propio primer si está en esta lista. Consulta la tabla interactiva en la página de Sanger o descarga el PDF.

Etiqueta de envío · Macrogen Chile

Label imprimible para envíos a la oficina de Santiago: Magdalena 140, Of. 401, Las Condes, 7550104. Incluye campos para nombre de cliente, número de reacciones y muestras, y barcode HC.

Datos de recepción · Macrogen Spain

Dirección oficial para envío de muestras al hub de Madrid: C. de Martínez Villergas 52, 28027 Madrid. Atención: Logística. Tel +34 911 138 378.

Guía envío DHL con hielo seco

Procedimiento oficial DHL para muestras que requieren dry-ice (RNA, tejidos frescos, gDNA frágil). Coordinación de pickup, declared value, peso máx de hielo seco e ISO 17025.

DHL Shipping procedure (with dry ice)

Official DHL procedure for samples requiring dry-ice transport. Pickup coordination, declared value, maximum dry-ice weight, and ISO 17025 compliance.

Procedimiento de envío SIN hielo seco DHL

Procedimiento DHL para muestras estables a temperatura ambiente (Sanger CES, DNA liofilizado, oligos). Sin dry-ice. Más económico y ágil.

DHL Shipping procedure (without dry ice)

DHL procedure for samples stable at ambient temperature (Sanger CES, lyophilized DNA, oligos). No dry-ice required. More economical and faster.

Procedimiento de envío CON hielo seco FedEx

Procedimiento FedEx para muestras de RNA, tejidos frescos o DNA frágil que requieren transporte refrigerado con dry-ice. Coordinación de courier, valor declarado y máximo de hielo seco.

FedEx Shipping procedure (with dry ice)

FedEx procedure for samples requiring dry-ice transport (RNA, fresh tissue, fragile gDNA). Courier coordination, declared value, and maximum dry-ice weight per FedEx IATA regulations.

FedEx Shipping procedure (without dry ice)

FedEx procedure for samples stable at ambient temperature (Sanger CES, DNA lyophilized, primers, oligos). Free shipping with >20 Sanger reactions.

FASTQ.gz Viewer + Quality Control

Inspecciona archivos .fastq.gz sin descomprimir + genera QC visual al instante: distribución Phred (Q30), contenido GC, y calidad por posición estilo FastQC. Lee directo del comprimido — no satura RAM.

• ✓ Visor estructural: primeras N lecturas (ID Illumina + secuencia + Phred)
• ✓ Histograma Phred (línea Q30 marcada)
• ✓ Histograma %GC (campana Gauss típica)
• ✓ Calidad por posición (estilo FastQC verde/amarillo/rojo)
• ✓ Submuestreo automático 10.000 lecturas (rápido en cualquier tamaño)

Para usar en Colab: descarga el .ipynb → abre Google Colab → menú File → Upload notebook → arrastra el archivo → ejecuta las celdas en orden. Sube tu .fastq.gz al panel lateral 📂 cuando llegues al paso 3.

Illumina Rawdata Sample Report

Reporte estándar de raw data Illumina: yield, Q30, GC%, adaptadores, contaminación, base composition. Documento previo al envío de FASTQ al pipeline.

Métricas de calidad WES (Español)

Reporte de métricas de calidad WES en español: target enrichment, on-target rate, coverage uniformidad, duplication rate, GC bias. Pensado para auditorías clínicas iberoamericanas.

PacBio WGS · mapping + CpG + SNP + SV + CNV

Reporte HTML completo PacBio HiFi · mapping a referencia + variant calling integral (SNP, structural variants, copy number), análisis de metilación CpG, Krona taxonomy y Circos plots. 100% offline navegable.

PacBio De Novo · Prokaryote

Ensamblaje de novo procariota con HiFi reads: contigs circulares, anotación CDS/rRNA/tRNA, N50/L50, comparación NCBI.

Nanopore Assembly · Sample Report

Reporte oficial de ensamblaje Oxford Nanopore: basecalling, QC reads, assembly (Flye/Canu), polishing (Medaka/Pilon), QUAST/BUSCO assessment. Ideal para microbiomas y genomas no humanos.

HumanWGS Basic · ISAAC4

Pipeline Illumina ISAAC4 aligner + variant caller integrado. Reporte HTML de QC + variants para WGS clínico humano.

HumanWGS Basic · GATK 4.5

GATK best practices · BWA + HaplotypeCaller · annotación ClinVar + VEP. Pipeline humano clínico estándar.

WGS Illumina Standard

Reporte HTML completo · GATK + ANNOVAR · variant calling germline y somatic.

WGS Novel · Illumina

De novo assembly short-read · contigs · stats N50/L50 · annotación.

Whole Genome Report (PDF)

Reporte estándar WGS humano descargable: SNV / Indel calling, anotación funcional ACMG/AMP, métricas de calidad, coverage histograms.

WGS Novel · PacBio HiFi

Long-read assembly · contigs circulares · structural variants · alta resolución.

Genome Survey · k-mer analysis

Estimación de tamaño de genoma, GC%, heterocigosidad y repeats por k-mer analysis. Para diseñar coverage previo al WGS.

WES Basic · Mapping + SNP

Reporte HTML · captura de exoma · variant annotation completa con ClinVar/COSMIC.

WES Sample Report v3

Pipeline estándar exome · 1 muestra · QC + variant calling + filtering.

WES Sample Report v4

Pipeline exome actualizado · GATK + ANNOVAR · annotación con ClinVar + COSMIC.

Whole Exome Sequencing (PDF)

Coverage por exón, variant calling (SNV + Indel), anotación ClinVar/COSMIC, filtros gnomAD y patogenicidad ACMG.

WES Basic · BI Example Report

Reporte ejemplo de WES Basic Bioinformatics: pipeline de exoma humano con anotación variantes, filtros poblacionales y predicción de patogenicidad (SIFT/PolyPhen).

WGBS · BSMAP human example

Whole Genome Bisulfite Sequencing report: BSMAP alignment, metilación CpG/CHG/CHH genome-wide, DMR (Differentially Methylated Regions), comparación entre condiciones.

ChIP-Seq

Peak calling MACS2, anotación vs TSS, motif discovery (MEME/HOMER), comparación entre condiciones, browser tracks.

Transcriptome Basic · Align + Expression + DEG

Reporte HTML completo de Transcriptómica Basic: alineamiento STAR/HISAT2, cuantificación featureCounts/RSEM, perfilamiento de expresión y análisis diferencial DESeq2/edgeR. Tablas dinámicas y heatmaps interactivos.

Transcriptome · DEG + VC + lncRNA + SNP

Reporte HTML extendido: análisis diferencial + variant calling sobre RNA-Seq + predicción de lncRNAs (CPC2/CPAT) + detección de SNPs en transcritos. Pipeline integral RNA.

Total RNA · TRR Report

Total RNA-Seq rRNA-depleted · QC + alineamiento + cuantificación completa.

mRNA-Seq Basic

mRNA-Seq con poly-A selection: QC, alineamiento HISAT2/STAR, cuantificación TPM/FPKM. Punto de partida transcriptómico.

Total RNA-Seq · rRNA-depleted

Captura mRNA + lncRNA + snoRNA. Ideal para descubrimiento de transcritos no codificantes y full-length isoform.

DEG · Non-Human

Análisis DEG (DESeq2/edgeR) para plantas, animales modelo, levaduras: volcano plots, heatmaps, MA plots.

DEG Human · GO/KEGG/VC/Fusion

Reporte DEG humano completo con enriquecimiento GO + pathway KEGG + variant calling RNA-Seq (VC) + gene fusions.

Small RNA · miRNA/snRNA/piRNA

Alineamiento miRBase, identificación de miRNAs novel, predicción de targets (miRanda/TargetScan), diferencial.

Reporte ASV · 16S Bayesian NCBI

Reporte HTML completo de pipeline ASV (Cutadapt + DADA2 + QIIME): pre-processing, taxonomía Bayesiana, alpha diversity (Shannon, Chao1, Faith's PD) y beta (PCoA Bray-Curtis · UniFrac · UPGMA).

🆕 Actualización 15 jun 2026: ahora también puedes personalizar el orden de las muestras (no solo los grupos) en Barplot, Heatmap, Diversity Index, Rarefaction, Distance Matrix y PCoA. Mismo flujo: Group Customization → Download Template → editar Excel → Upload.

Shotgun Metagenomics report

Reporte HTML Shotgun metagenomics: clasificación taxonómica Kraken2/Bracken, functional annotation (KEGG/COG), pathway reconstruction y MAGs. 100% offline navegable.

Sequencing QC report · SRS + LRS

Reporte estándar de control de calidad pre-secuenciación: integridad RNA (RIN), pureza DNA (260/280, 260/230), gel/TapeStation, concentración Qubit y aprobación para library prep.

dna.macrogen.com · acceso unificado

Portal único para cotizar, registrar pedidos, hacer seguimiento, descargar resultados y gestionar facturación. Soporta multi-usuario por institución y exportes para purchasing.

Datos de pago & facturación

Facturación en USD (Chile/Perú) o EUR (España/Portugal). Transferencia bancaria o tarjeta corporativa. Net 30 disponible para clientes institucionales validados.